Heating preserves RNA integrity when extracting snap frozen tissue

29th February

Heating preserves RNA integrity when extracting snap frozen tissue using new RNA stability indicator from TATAA (Denator and TATAA Biocenter).

» qPCR based mRNA quality score show intact mRNA after heat stabilization

» Differential amplicons (ΔAmp)—a new molecular method to assess RNA integrity

The Clinical NGS landscape

19th February

The Clinical NGS landscape presented by DeciBio, TATAA contributed to the expert panel.

» Clinical NGS testing landscape: Illumina to remain dominant, with competitors addressing  niche opportunities based on differentiated platform attributes

» TATAA NGS services

One of the key elements to a successful Next Generation Sequencing (NGS) project is in the experimental setup. Together with you we can design your NGS project to fit your research interests and budget. TATAA Biocenter will assist you through the whole NGS workflow with library preparation, quality controls, sequencing, and data analysis.

Webinar: NGS large scale analysis

17th February

Streamlining large scale analysis using the Strand NGS Pipeline Manager

Abstract:

Strand NGS includes comprehensive workflows for DNA-Seq, RNA-Seq, Small RNA-Seq, ChIP-Seq, MeDIP-Seq, and Methyl-Seq analysis. Each workflow includes a quality assessment and filter section, followed by a workflow-specific analysis section. The pipeline functionality in Strand NGS allows users to execute a sequence of analysis steps with specific parameters – all without any manual intervention. This simplifies the analysis in large scale sequencing projects where every sample needs to be processed identically.

In this webinar we will discuss the pre-packaged pipelines present in Strand NGS. The packaged pipelines have well-chosen default parameters and are suitable for users analyzing data for the first time in the tool. We will also show how advanced users can customize pipelines and share them with other Strand NGS users. Finally, we will show a brief glimpse of an elaborate pipeline that aligns reads, filters poor-quality matches, computes coverage metrics, identifies variants, checks for sample cross-contamination, and emails quality reports – all from within Strand NGS.

Speaker:

Dr. Vamsi Veeramachaneni, Vice President – Bioinformatics, Strand Life Sciences

» Registration

Strand NGS Thumbnail

Från Neandertalmänniskan till den designade babyn

16th February

Söker ni en talare till er kick-off, årsmöte, frukostmöte, utbildningsdagar eller middag? Hyr talare från TATAA för ditt event!

Just nu erbjuder vi den populära föreläsningen:

“Från Neandertalmänniskan till den designade babyn”

Lyssna på en spännande föreläsning om genetik; hur den påverkat oss, hur den används idag och vad som kommer vara möjligt i framtiden. Under en föreläsning får åhörarna en fascinerande inblick i hur man kan anpassa livsstilen till sin egna genetiska profil och hur man kan reparera genetiska defekter hos foster.

> Läs mer om talaren Mikael Kubista

> Skicka en förfrågan till training@tataa.com, eller ring oss på 031-761 57 00

TATAA Biocenter in Astra Zeneca’s BioVentureHub

11th February

TATAA Biocenter intensifies collaboration with AstraZeneca and companies in the BioVentureHub


AstraZeneca’s BioVentureHub expanding with leading science

Pressmeddelande  •  2016-02-11 08:00 CET
Two new companies have moved into the BioVentureHub at AstraZeneca Gothenburg, bringing the total to 17 companies and 1 academic group.

The newcomers are: Promimic, developers of an innovative implant surface that mimics living bone tissue, and TATAA Biocenter, experts in nucleic acid and protein analyses.

Magnus Björsne, AstraZeneca’s Executive Director for the BioVentureHub (BVH), is excited to welcome the new companies to the Gothenburg site: “Promimic and TATAA Biocenter are terrific additions to the BioVentureHub. They lead scientific innovation in their respective fields and add new capabilities, ideas and perspectives into the hub mix.”

AstraZeneca established the BVH in 2014 to stimulate open and collaborative innovation and to strengthen competitiveness in the Scandinavian life sciences. Supporting the AstraZeneca Gothenburg site vision to be one of the best R&D sites in the world, the BVH gives emerging biotech/medtech companies and academic groups a unique opportunity to co-locate and interact with AstraZeneca’s scientists and state-of-the-art lab facilities and infrastructure, and with each other.

Promimic has moved into the BVH to further develop its innovative HAnano Surface, which represents a new generation of implant surfaces based on synthetic bone minerals.

“We started our journey of growth last year. To ensure that we can continue to satisfy our customers and to stay at the forefront of product innovation, we needed to upgrade our facilities. Moving into the BioVentureHub and having access to the AstraZeneca labs and infrastructure provides us with the ideal foundation on which we can build the future growth and success of our company,” says Ulf Brogren, CEO of Promimic.

TATAA Biocenter, located in Göteborg (Sweden), Prague (Czech Republic) and Saarbrucken, (Germany), has opened an R&D unit in the BioVentureHub. The unit is led by Dr Robert Sjöback, and will develop TATAA’s novel technology for exceedingly sensitive and specific analysis of microRNAs, as well as quality control products for molecular analyses.

”As we develop innovative methods and products, it is extremely valuable for our R&D team to be embedded amongst interested and knowledgeable potential users that provide input during the development stage and then support our testing and validation”, says Mikael Kubista, CEO and founder of TATAA Biocenter.

About AstraZeneca BioVentureHub

AstraZeneca established the BioVentureHub in 2014 as an open innovation ecosystem to further strengthen competitiveness and dynamism in the Scandinavian life science industry. Based on an innovative public-private partnership model and located at the heart of AstraZeneca Gothenburg, the BioVenturehub gives emerging biotech/medtech companies and academic groups from Sweden and abroad a unique opportunity to co-locate with – and tap into – the power of AstraZeneca’s world-class scientists and state-of-the-art lab facilities and infrastructure, and with each other. www.azbioventurehub.com

About AstraZeneca

AstraZeneca is a global, innovation-driven biopharmaceutical business that focuses on the discovery, development and commercialisation of prescription medicines, primarily for the treatment of diseases in three main therapy areas – respiratory, inflammation, autoimmune disease (RIA), cardiovascular and metabolic disease (CVMD) and oncology – as well as in infection and neuroscience. AstraZeneca operates in over 100 countries and its innovative medicines are used by millions of patients worldwide. For more information please visit: www.astrazeneca.com

About Promimic

Promimic has developed a process that makes it possible to modify all types of implant materials and geometries with a nanometer-thin surface of synthetic bone minerals; HAnano Surface. It is based on the substance hydroxyapatite (HA)., which by size, shape, structure and chemistry mimics the living bone tissue. The HAnanoSurface is licensed to dental and orthopaedic implants companies. Promimic is a spin-off company based on research from Chalmers University of Technology. For more information about the company, please visit the web page: www.promimic.com

About TATAA Biocenter

TATAA Biocenter is the world’s largest organizer of hands-on training in molecular analyses, Europe’s leading provider of nucleic acid analysis services, and Scandinavia’s most comprehensive distributor of products for nucleic acids analyses. Through its laboratories in Göteborg, Sweden, and Prague, Czech Republic, and sales office in Saarbrucken, Germany, TATAA Biocenter supports its clients with products for full range of nucleic acid and protein analyses and services in compliance with ISO17025 standard. In 2013, TATAA Biocenter was presented the Frost & Sullivan Award for Customer Value Leadership as Best-in-Class Services for Analyzing Genetic Material. In 2015, TATAA separated its consumer diagnostic service business into Life Genomics AB. For more information visit www.tataa.com

Contact

Jacob Lund, AstraZeneca Sweden: +46 8-553 260 20/+ 46 72-560 2157

High throughput NIPT laboratory and consumer genomic testing

10th February

Life Genomics raises capital for high throughput NIPT laboratory and consumer genomic testing

logo_color

Life Genomics får kapitaltillskott från Bure Equity för att kunna erbjuda alla gravida säkrare fostertest

Gentestföretaget Life Genomics tar in nytt riskkapital från investeringsbolaget Bure Equity via dotterbolaget Bure Growth för att utveckla sin laboratoriekapacitet inom främst fostertestning. Sedan tidigare är statliga Almi Invest delägare. Företagets s.k. NIPT-test avslöjar med ett enkelt blodprov på mamman eventuella kromosomskador hos fostret redan från tionde veckan. Idag kan NIPT bara erbjudas av privata mödravårdscentraler och för vissa riskgrupper på Karolinska Sjukhuset i Stockholm och måste normalt bekostas av de blivande föräldrarna. – Vi kommer nu i samarbete med en ledande global leverantör av NIPT-teknologi att sätta upp Europas första ackrediterade storskaliga NIPT- laboratorium. På så vis kommer kostnaderna för testet att kunna reduceras så att samhället får råd att erbjuda det till alla gravida. Den stora vinsten är att vi dramatiskt kan reducera antalet blivande mödrar, som behöver genomgå fostervattenprov med risk för missfall. Dessutom leder det till omfattande besparingar för sjukvården och samhället, säger Mikael Kubista, VD för Life Genomics.

Life Genomics ökar sin laboratoriekapacitet

NIPT-testet är enklare, säkrare och mer tillförlitligt än dagens testmetoder och introducerades i Sverige av Life Genomics 2014. Förra året rekommenderades testet av Statens Beredning för Medicinsk och Social Utvärdering (SBU). De s.k. KUB-tester (kombinerat ultraljud och blodprov), som erbjuds kvinnor sedan 2006 har en hög andel falskt positiva resultat som kompletteras med fostervattenprov, som i sin tur kan leda till missfall i ungefär ett fall av hundra. – Resultatet från en internationell klinisk NIPT-studie, med deltagande från Sahlgrenska universitetssjukhuset, på över 145 000 gravida kvinnor visade att NIPT ger en betydligt högre träffsäkerhet med mycket färre falskt positiva resultat och därmed mycket färre fostervattenprov än KUB. Vår strävan är att uppnå en jämlik vård över ålder och region, säger Mikael Kubista.

Gentest som hjälper att planera kost och motion

Life Genomics affärsidé är att utveckla och erbjuda genetiska tester som inte erbjuds den vanlige konsumenten av den offentliga vården. Det kan handla om genetisk information som är av betydelse för var och ens välmående men som inte är av akut art. Ett exempel är företagets nutrigenetiska analys, Life Nutritest, som slår fast hur effektivt man tar upp olika näringsämnen och vitaminer, påverkas av koffein, laktos och alkohol, vilken typ av muskulatur och metabolism man har och andra faktorer som hjälper till att planera kost och träning. Testet säljs genom Life hälsobutiker. Life Genomics har fler genetiska tester, som kommer att lanseras framöver.

Kraftigt ökad efterfrågan globalt

Life Genomics är avknoppning från TATAA Biocenter, som sedan 2001 erbjuder genetisk analysservice till ledande läkemedelsföretag och akademiska forskare i ett av Europas bäst utrustade laboratorier. Statliga investmentbolaget Almi Invest och investeringsbolaget Bure Growth är delägare.

– Life Genomics gör samhällsnytta genom att företagets lösningar kan spara pengar för den offentliga sektorn. Sedan vi investerade för ett år sedan har Life Genomics bevisat att konceptet håller och trimmat in verksamheten. Nu välkomnar vi Bure Growth som investerare och tillsammans skall vi med det ytterst kompetenta teamet på Life Genomics skala upp verksamheten rejält då vi ser att intresset för gentester växer allt starkare, säger Joakim Winggren, Fund Manager hos Almi Invest.

– Kostnaden för genetiska analyser har minskat dramatiskt, vilket leder till kraftigt ökad efterfrågan globalt. Vi vill bidra till att erbjuda konsumentmarknaden detta som komplement till den offentliga sektorns erbjudanden, säger Fredrik Mattsson, Investment Director hos Bure Growth.

Om Life Genomics

Life Genomics DNA-analyser grundas på 25 års forskning vid Chalmers Tekniska Högskola och hos TATAA Biocenter och flera andra tester finns redan på marknaden, bland annat TATAA Biocenters analys av cirkulerande tumörceller och kvalitetstestet ValidPrime.  År 2013 utsågs TATAA Biocenter till Europas främsta laboratorium för genetiska analyser av analysföretaget Frost & Sullivan. Företaget Life Genomics grundades 2014 som avknoppning från TATAA Biocenter med stöd av bl.a. ALMI invest, för att utveckla erbjudanden av genetiska tester till konsumentmarknaden.

Om Bure Equity

Bure bildades 1992 ur de avvecklade löntagarfonderna och noterades på Nasdaq Stockholm 1993. Genom att aktivt utveckla en diversifierad portfölj av professionellt förvaltade bolag och verksamheter är Bures mål att skapa värde och avkastning till sina aktieägare. Grundstenarna i Bures affärsmodell är djupt engagemang och hög närvaro i portföljbolagen. På så sätt byggs kompetens inom de branscher där portföljbolagen är verksamma. I portfölj finns idag flera verksamheter där Bure varit involverade under lång tid och bidragit till en framgångsrik utveckling.

För ytterligare information:

Mikael Kubista, VD Life Genomics AB, tel 073 392 81 68, mikael.kubista@lifegenomics.se

Fredrik Mattsson, Investment Director, Bure Equity AB, tel 08-614 00 20/24, fredrik.mattson@bure.se

Information om NIPT finns på: www.fostertest.se

Information om Life Nutritest finns på: www.nutritest.se

Whole Genome Amplification for Single Cells or Minor Genome

9th February

TATAA Biocenter and Yikon Genomics announce strategic partnership to distribute Yikon’s MALBAC™ products for single cell profiling and YK-PGS™ Solutions in Europe

TATAA Biocenter also to introduce Yikon’s MALBAC™ in its popular NGS training courses.

> Tataa_Yikon_Press Release


 

> MALBAC™ Single Cell WGA Kit

MALBAC Single Cell WGA Kit is based on the novel patented MALBAC technology, and provides rapid, reliable and reproducible whole genome amplification from single cells or equivalent gDNA (picogram level) to produce 2-4 micrograms of amplified gDNA in about 4 hours.

The kit is able to achieve >90% amplification success rate and consistent amplification efficiency in both AT- and GC-rich regions for most cell types, such as single blastomere, polar bodies, single sperm and single cells from cultured cell lines.

The kit generates reproducible loci representation, achieving>0.9 correlation coefficient for Qpcr Ct values among reaction replicates. More than 90% of genetic loci over a genome can be amplified then analyzed by various plat forms, such as real-time PCR (qPCR) and next-generation sequencing.

The kit can also be used to amplify sub-nanogram level of inputting g DNA (e.g. from hundreds of cells).

MALBAC Single Cell WGA kit_Applications

Workflow_MALBAC single cell wga kit